杨若林

一、基本情况　　

1995-1999 本科 兰州大学生物学专业国家基地班

1999-2002 硕士 兰州大学细胞生物学专业（保送）

2002-2005 教师 上海大学生命科学院

2005-2008 博士 中科院昆明动物研究所 比较和进化基因组学

2009-2011 博士后 中科院遗传和发育生物学研究所 进化发育生物学

2011-2014 博士后 美国亚利桑那大学植物学系 生物信息学

2014 至今， 西北农林科技大学教授 博士生导师

二、招生专业    

1. 遗传学

2. 生物信息学

三、主要科研领域与方向

 1. 生物信息学

 2. 表观基因组学

 3. 比较和进化基因组学

 4. 群体遗传学

四、近三年承担的主要科研项目

1. 横向项目：基于生物信息策略挖掘绵羊繁殖性状关键基因（30 万）

2. 国家自然基金面上项目：植物胚乳印迹基因的比较和进化基因组学研究 （65 万）

3. 国家自然基金面上项目：运用基于系统发育感知的渐进式迁移学习方法框架解析被子植物调控语法进化（54 万）

 五、近三年代表性科研成果　　

1. Genome Size Evolution Mediated by Gypsy Retrotransposons in Brassicaceae. Shi-Jian Zhang, Lei Liu, Ruolin Yang*, Xiangfeng Wang*. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2020, 18(3):321-332. 中科院 1 区

2. Selection and introgression facilitated the adaptation of Chinese native endangered cattle in extreme environments. Xinfeng Liu#, Zhaohong Li#, Yubin Yan, Ye Li, Hui Wu, Jie Pei, Ping Yan, Ruolin Yang*, Xian Guo*, Xianyong Lan*. Evol Appl. 2020, 14(3):860-873. 中科院 1 区

3. Identification and characterization of male reproduction-related genes in pig (Sus scrofa) using transcriptome analysis. Wenjing Yang, Feiyang Zhao, Mingyue Chen, Ye Li, Xianyong Lan, Ruolin Yang*, Chuanying Pan*. BMC Genomics. 2020, 21(1):381. 中科院 2 区

4. ICGEC: a comparative method for measuring epigenetic conservation of genes via the integrated signal from multiple histone modifications between cell types. Jing Tang#, Zefeng Wu#, Yuhan Tian, Ruolin Yang*. BMC Genomics. 2020, 21(1):356. 中科院 2 区

5. Correlated Evolution of Large DNA Fragments in the 3D Genome of Arabidopsis thaliana. Yubin Yan#, Zhaohong Li#, Ye Li, Zefeng Wu, Ruolin Yang*. Mol Biol Evol. 2020, 37(6):1621-1636. 中科院 1 区

6. Deciphering the regulatory code of histone modifications in plants. Li Zhaohong Li#, Dongwei Li#, Ye Li, Xiaoping Guo, Ruolin Yang R*. J Genet Genomics. 2022, S1673-8527(22)00183-7. 中科院 1 区

7. Splicing complexity as a pivotal feature of alternative exons in mammalian species. Zhao F#, Yan Y#, Wang Y, Liu Y, Yang R. BMC Genomics. 2023, 24(1):198 中科院 2区

8. Interchromosomal Colocalization with Parental Genes Is Linked to the Function and Evolution of Mammalian Retrocopies. Yan Y, Tian Y, Wu Z, Zhang K, Yang R. Mol Biol Evol. 2023, 40(12) 中科院1 区

#并列第一作者； *:通讯作者　

六、联系方式

西北农林科技大学北校区伟德BETVLCTOR1946，陕西杨陵，712100

办公室：伟德BETVLCTOR1946理科楼D407

实验室：伟德BETVLCTOR1946理科楼D407　　

Email: yang_ruolin@hotmail.com　　

Nothing in biology makes sense except in the light of evolution

      热忱欢迎对基因组学，进化遗传学，生物信息学，表观遗传学感兴趣的同学加入本课题组， 一起探索生命奥秘！